Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gjb3P28231 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb3P28231 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb3P28231 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms