Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjb1P28230 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb1P28230 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb1P28230 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms