Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-DMaP28078 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms