Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl3P27659 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl3P27659 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms