Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CftrP26361 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CftrP26361 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CftrP26361 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CftrP26361 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CftrP26361 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CftrP26361 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CftrP26361 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CftrP26361 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CftrP26361 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CftrP26361 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CftrP26361 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CftrP26361 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CftrP26361 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CftrP26361 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CftrP26361 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CftrP26361 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
CftrP26361 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CftrP26361 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CftrP26361 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CftrP26361 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CftrP26361 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CftrP26361 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CftrP26361 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CftrP26361 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CftrP26361 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CftrP26361 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CftrP26361 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CftrP26361 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CftrP26361 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CftrP26361 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CftrP26361 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CftrP26361 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CftrP26361 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CftrP26361 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CftrP26361 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CftrP26361 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CftrP26361 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CftrP26361 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CftrP26361 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CftrP26361 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CftrP26361 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CftrP26361 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CftrP26361 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CftrP26361 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CftrP26361 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CftrP26361 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CftrP26361 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
CftrP26361 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CftrP26361 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CftrP26361 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CftrP26361 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CftrP26361 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CftrP26361 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CftrP26361 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CftrP26361 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CftrP26361 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CftrP26361 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
CftrP26361 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CftrP26361 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CftrP26361 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CftrP26361 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CftrP26361 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CftrP26361 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CftrP26361 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CftrP26361 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CftrP26361 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CftrP26361 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CftrP26361 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CftrP26361 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CftrP26361 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CftrP26361 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CftrP26361 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CftrP26361 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CftrP26361 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CftrP26361 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CftrP26361 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CftrP26361 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CftrP26361 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CftrP26361 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CftrP26361 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CftrP26361 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CftrP26361 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CftrP26361 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CftrP26361 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CftrP26361 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CftrP26361 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CftrP26361 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CftrP26361 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CftrP26361 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CftrP26361 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CftrP26361 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CftrP26361 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CftrP26361 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CftrP26361 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CftrP26361 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CftrP26361 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CftrP26361 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CftrP26361 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CftrP26361 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms