Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nfkb1P25799 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfkb1P25799 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb1P25799 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms