Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf1bP25119 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf1bP25119 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf1bP25119 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfrsf1bP25119 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf1bP25119 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf1bP25119 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf1bP25119 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf1bP25119 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf1bP25119 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf1bP25119 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf1bP25119 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms