Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfaP23607 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfaP23607 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZfaP23607 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfaP23607 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfaP23607 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfaP23607 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfaP23607 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZfaP23607 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZfaP23607 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfaP23607 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZfaP23607 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms