Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkchP23298 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkchP23298 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkchP23298 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PrkchP23298 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkchP23298 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkchP23298 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkchP23298 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkchP23298 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrkchP23298 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkchP23298 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkchP23298 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkchP23298 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms