Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clk1P22518 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Clk1P22518 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk1P22518 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk1P22518 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk1P22518 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk1P22518 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk1P22518 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk1P22518 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk1P22518 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk1P22518 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms