Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn1P22387 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn1P22387 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn1P22387 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn1P22387 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn1P22387 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edn1P22387 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn1P22387 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn1P22387 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms