Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmnb2P21619 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmnb2P21619 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmnb2P21619 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms