Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc2P20801 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc2P20801 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms