Protein–RNA interactions for Protein: P20109

Il13, Interleukin-13, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il13P20109 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Il13P20109 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Il13P20109 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Il13P20109 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Il13P20109 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Il13P20109 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Il13P20109 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Il13P20109 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Il13P20109 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Il13P20109 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Il13P20109 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Il13P20109 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Il13P20109 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Il13P20109 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Il13P20109 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Il13P20109 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Il13P20109 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Il13P20109 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Il13P20109 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Il13P20109 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Il13P20109 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Il13P20109 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Il13P20109 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Il13P20109 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Il13P20109 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Il13P20109 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Il13P20109 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Il13P20109 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Il13P20109 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il13P20109 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il13P20109 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il13P20109 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il13P20109 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il13P20109 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il13P20109 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il13P20109 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il13P20109 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Il13P20109 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il13P20109 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il13P20109 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il13P20109 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il13P20109 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il13P20109 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Il13P20109 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Il13P20109 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Il13P20109 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Il13P20109 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Il13P20109 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Il13P20109 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Il13P20109 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Il13P20109 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Il13P20109 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Il13P20109 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Il13P20109 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il13P20109 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il13P20109 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il13P20109 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il13P20109 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il13P20109 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il13P20109 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il13P20109 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il13P20109 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il13P20109 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il13P20109 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il13P20109 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il13P20109 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il13P20109 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il13P20109 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il13P20109 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il13P20109 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il13P20109 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il13P20109 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il13P20109 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il13P20109 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il13P20109 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il13P20109 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il13P20109 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il13P20109 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il13P20109 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il13P20109 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il13P20109 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms