Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18525 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18525 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18525 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18525 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18525 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18525 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
P18525 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18525 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18525 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18525 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18525 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18525 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18525 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18525 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18525 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18525 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18525 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18525 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P18525 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18525 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18525 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18525 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18525 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18525 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18525 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18525 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18525 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18525 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18525 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18525 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18525 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18525 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18525 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18525 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18525 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18525 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18525 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18525 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18525 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P18525 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18525 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P18525 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P18525 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18525 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18525 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18525 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18525 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18525 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18525 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18525 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18525 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18525 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18525 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18525 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18525 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18525 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18525 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18525 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18525 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18525 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18525 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18525 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18525 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18525 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18525 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18525 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18525 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18525 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18525 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18525 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18525 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18525 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18525 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18525 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18525 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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