Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcnaP17918 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcnaP17918 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcnaP17918 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcnaP17918 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcnaP17918 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PcnaP17918 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcnaP17918 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcnaP17918 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcnaP17918 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PcnaP17918 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PcnaP17918 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PcnaP17918 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PcnaP17918 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PcnaP17918 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PcnaP17918 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PcnaP17918 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PcnaP17918 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PcnaP17918 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PcnaP17918 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PcnaP17918 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms