Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgfb3P17125 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms