Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp53P15975 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp53P15975 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp53P15975 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp53P15975 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp53P15975 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp53P15975 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp53P15975 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp53P15975 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp53P15975 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms