Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmnb1P14733 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmnb1P14733 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmnb1P14733 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmnb1P14733 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms