Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Dnmt1P13864 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Dnmt1P13864 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Dnmt1P13864 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Dnmt1P13864 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Dnmt1P13864 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Dnmt1P13864 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Dnmt1P13864 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Dnmt1P13864 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Dnmt1P13864 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Dnmt1P13864 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms