Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fv4P11370 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fv4P11370 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv4P11370 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv4P11370 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv4P11370 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv4P11370 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv4P11370 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv4P11370 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv4P11370 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv4P11370 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv4P11370 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv4P11370 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv4P11370 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms