Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl2P10889 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl2P10889 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl2P10889 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms