Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsbP10605 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsbP10605 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsbP10605 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsbP10605 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsbP10605 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsbP10605 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsbP10605 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsbP10605 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms