Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myod1P10085 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myod1P10085 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myod1P10085 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myod1P10085 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myod1P10085 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myod1P10085 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myod1P10085 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myod1P10085 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Myod1P10085 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myod1P10085 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms