Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UbbP0CG49 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UbbP0CG49 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms