Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igsf6P0C6B7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf6P0C6B7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf6P0C6B7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf6P0C6B7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf6P0C6B7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf6P0C6B7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf6P0C6B7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf6P0C6B7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf6P0C6B7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms