Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Surf1P09925 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Surf1P09925 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf1P09925 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Surf1P09925 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Surf1P09925 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Surf1P09925 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Surf1P09925 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Surf1P09925 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Surf1P09925 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms