Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxb8P09632 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms