Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifna9P09235 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms