Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col3a1P08121 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col3a1P08121 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Col3a1P08121 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col3a1P08121 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms