Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apoa4P06728 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa4P06728 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Apoa4P06728 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa4P06728 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa4P06728 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa4P06728 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa4P06728 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa4P06728 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa4P06728 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa4P06728 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa4P06728 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa4P06728 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa4P06728 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa4P06728 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa4P06728 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa4P06728 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa4P06728 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa4P06728 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa4P06728 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa4P06728 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa4P06728 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa4P06728 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa4P06728 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apoa4P06728 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms