Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06330 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06330 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06330 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06330 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06330 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06330 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06330 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06330 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06330 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P06330 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06330 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06330 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06330 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06330 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06330 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06330 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06330 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06330 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06330 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06330 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P06330 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06330 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06330 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06330 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06330 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06330 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06330 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06330 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06330 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06330 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06330 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06330 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06330 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06330 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06330 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06330 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06330 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06330 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06330 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06330 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06330 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06330 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06330 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms