Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06329 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06329 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06329 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06329 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06329 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06329 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06329 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06329 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06329 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06329 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06329 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06329 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06329 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06329 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06329 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P06329 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06329 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06329 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06329 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06329 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06329 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06329 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06329 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06329 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06329 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06329 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06329 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06329 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06329 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06329 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P06329 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06329 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06329 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06329 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06329 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06329 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06329 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06329 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06329 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P06329 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06329 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.8 ms