Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Got1P05201 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Got1P05201 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Got1P05201 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Got1P05201 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Got1P05201 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Got1P05201 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Got1P05201 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Got1P05201 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Got1P05201 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Got1P05201 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Got1P05201 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Got1P05201 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Got1P05201 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Got1P05201 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Got1P05201 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Got1P05201 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Got1P05201 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Got1P05201 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Got1P05201 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Got1P05201 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Got1P05201 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Got1P05201 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Got1P05201 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Got1P05201 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Got1P05201 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Got1P05201 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Got1P05201 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Got1P05201 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Got1P05201 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Got1P05201 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Got1P05201 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Got1P05201 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Got1P05201 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Got1P05201 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Got1P05201 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Got1P05201 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Got1P05201 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Got1P05201 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Got1P05201 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Got1P05201 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Got1P05201 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Got1P05201 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Got1P05201 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Got1P05201 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Got1P05201 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Got1P05201 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Got1P05201 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Got1P05201 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Got1P05201 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Got1P05201 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Got1P05201 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Got1P05201 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Got1P05201 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Got1P05201 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Got1P05201 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Got1P05201 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Got1P05201 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Got1P05201 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Got1P05201 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Got1P05201 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Got1P05201 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Got1P05201 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.8 ms