Protein–RNA interactions for Protein: P03985

T-cell receptor gamma chain C region C7.5, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03985 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03985 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03985 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03985 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03985 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03985 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03985 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03985 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P03985 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P03985 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P03985 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P03985 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P03985 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms