Protein–RNA interactions for Protein: P03985

T-cell receptor gamma chain C region C7.5, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03985 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03985 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03985 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03985 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03985 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03985 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03985 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03985 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03985 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03985 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03985 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03985 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P03985 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P03985 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03985 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03985 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03985 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03985 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03985 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P03985 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P03985 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P03985 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P03985 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms