Protein–RNA interactions for Protein: P02469

Lamb1, Laminin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb1P02469 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamb1P02469 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamb1P02469 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamb1P02469 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamb1P02469 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamb1P02469 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms