Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01896 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01896 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01896 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01896 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01896 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01896 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01896 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01896 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01896 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01896 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01896 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01896 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01896 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01896 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01896 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01896 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01896 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01896 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01896 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01896 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01896 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01896 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01896 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01896 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01896 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01896 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01896 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01896 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01896 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01896 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01896 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01896 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01896 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01896 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01896 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01896 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01896 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01896 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01896 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01896 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01896 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01896 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01896 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01896 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01896 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01896 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01896 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01896 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01896 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01896 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01896 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01896 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01896 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01896 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms