Protein–RNA interactions for Protein: P01831

Thy1, Thy-1 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thy1P01831 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thy1P01831 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thy1P01831 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thy1P01831 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thy1P01831 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thy1P01831 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thy1P01831 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms