Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01823 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01823 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01823 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01823 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01823 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01823 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01823 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01823 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01823 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01823 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01823 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01823 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01823 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01823 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01823 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01823 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01823 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01823 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01823 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01823 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01823 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P01823 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01823 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01823 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01823 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01823 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01823 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01823 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01823 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01823 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01823 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01823 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01823 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01823 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01823 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01823 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01823 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P01823 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01823 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01823 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01823 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01823 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01823 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01823 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01823 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01823 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01823 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01823 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01823 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01823 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01823 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01823 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01823 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01823 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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