Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01810 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01810 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01810 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01810 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01810 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01810 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01810 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
P01810 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01810 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01810 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01810 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P01810 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01810 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01810 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01810 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01810 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01810 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01810 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01810 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01810 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01810 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01810 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01810 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01810 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01810 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01810 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01810 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01810 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01810 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01810 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01810 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01810 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01810 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01810 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01810 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01810 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01810 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01810 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01810 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01810 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01810 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01810 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01810 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01810 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01810 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01810 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01810 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01810 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01810 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01810 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01810 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01810 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01810 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01810 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01810 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01810 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P01810 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P01810 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01810 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01810 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01810 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01810 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01810 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01810 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01810 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01810 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01810 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01810 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01810 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01810 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01810 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01810 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01810 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01810 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01810 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01810 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01810 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01810 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01810 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01810 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01810 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01810 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01810 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01810 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01810 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01810 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01810 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01810 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01810 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01810 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms