Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01757 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01757 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01757 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01757 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01757 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01757 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01757 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01757 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01757 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01757 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01757 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01757 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01757 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01757 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01757 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01757 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01757 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01757 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01757 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01757 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01757 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01757 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01757 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01757 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01757 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01757 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01757 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01757 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01757 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01757 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01757 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01757 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01757 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01757 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01757 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01757 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01757 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01757 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01757 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01757 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01757 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01757 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01757 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01757 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01757 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01757 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01757 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01757 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms