Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01649 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01649 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01649 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01649 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01649 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01649 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01649 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01649 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01649 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01649 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01649 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01649 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01649 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01649 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01649 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01649 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01649 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01649 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01649 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01649 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01649 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01649 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01649 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01649 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01649 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01649 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01649 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01649 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01649 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01649 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01649 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01649 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01649 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01649 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01649 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01649 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01649 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01649 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01649 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01649 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01649 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01649 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01649 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01649 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01649 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01649 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01649 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01649 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01649 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01649 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01649 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01649 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01649 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01649 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01649 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01649 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01649 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01649 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01649 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01649 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01649 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01649 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01649 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01649 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01649 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01649 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01649 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01649 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01649 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01649 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01649 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01649 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01649 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01649 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01649 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01649 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01649 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01649 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01649 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01649 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01649 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01649 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01649 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01649 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01649 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01649 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01649 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01649 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01649 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01649 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms