Protein–RNA interactions for Protein: P00342

Ldhc, L-lactate dehydrogenase C chain, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhcP00342 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LdhcP00342 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LdhcP00342 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LdhcP00342 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LdhcP00342 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LdhcP00342 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LdhcP00342 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LdhcP00342 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LdhcP00342 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhcP00342 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LdhcP00342 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhcP00342 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhcP00342 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdhcP00342 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhcP00342 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhcP00342 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdhcP00342 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms