Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CopeO89079 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CopeO89079 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CopeO89079 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CopeO89079 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CopeO89079 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopeO89079 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopeO89079 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CopeO89079 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopeO89079 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopeO89079 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopeO89079 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopeO89079 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopeO89079 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CopeO89079 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopeO89079 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopeO89079 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopeO89079 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopeO89079 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopeO89079 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopeO89079 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopeO89079 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CopeO89079 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CopeO89079 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CopeO89079 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CopeO89079 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CopeO89079 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CopeO89079 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopeO89079 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CopeO89079 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopeO89079 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopeO89079 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopeO89079 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopeO89079 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CopeO89079 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CopeO89079 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CopeO89079 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CopeO89079 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CopeO89079 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopeO89079 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopeO89079 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CopeO89079 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopeO89079 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopeO89079 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopeO89079 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopeO89079 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopeO89079 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopeO89079 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopeO89079 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopeO89079 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopeO89079 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopeO89079 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CopeO89079 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopeO89079 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopeO89079 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopeO89079 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopeO89079 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CopeO89079 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CopeO89079 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CopeO89079 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CopeO89079 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CopeO89079 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopeO89079 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopeO89079 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopeO89079 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopeO89079 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopeO89079 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopeO89079 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopeO89079 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CopeO89079 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CopeO89079 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CopeO89079 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CopeO89079 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CopeO89079 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CopeO89079 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CopeO89079 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CopeO89079 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CopeO89079 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopeO89079 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopeO89079 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopeO89079 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopeO89079 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopeO89079 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopeO89079 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopeO89079 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopeO89079 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopeO89079 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CopeO89079 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CopeO89079 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms