Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CpdO89001 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CpdO89001 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CpdO89001 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CpdO89001 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CpdO89001 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CpdO89001 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CpdO89001 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CpdO89001 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CpdO89001 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CpdO89001 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CpdO89001 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CpdO89001 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CpdO89001 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CpdO89001 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CpdO89001 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CpdO89001 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CpdO89001 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CpdO89001 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CpdO89001 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CpdO89001 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CpdO89001 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CpdO89001 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CpdO89001 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CpdO89001 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CpdO89001 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CpdO89001 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CpdO89001 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CpdO89001 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CpdO89001 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CpdO89001 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CpdO89001 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CpdO89001 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CpdO89001 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CpdO89001 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CpdO89001 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CpdO89001 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CpdO89001 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CpdO89001 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CpdO89001 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CpdO89001 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CpdO89001 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CpdO89001 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CpdO89001 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CpdO89001 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CpdO89001 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CpdO89001 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CpdO89001 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CpdO89001 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CpdO89001 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CpdO89001 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CpdO89001 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CpdO89001 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CpdO89001 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CpdO89001 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CpdO89001 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CpdO89001 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CpdO89001 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CpdO89001 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CpdO89001 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CpdO89001 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CpdO89001 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CpdO89001 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CpdO89001 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CpdO89001 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CpdO89001 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CpdO89001 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CpdO89001 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CpdO89001 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CpdO89001 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CpdO89001 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CpdO89001 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CpdO89001 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CpdO89001 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CpdO89001 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CpdO89001 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CpdO89001 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CpdO89001 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CpdO89001 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CpdO89001 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CpdO89001 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CpdO89001 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CpdO89001 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CpdO89001 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CpdO89001 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CpdO89001 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CpdO89001 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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