Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx8O88983 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx8O88983 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx8O88983 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx8O88983 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx8O88983 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx8O88983 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx8O88983 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stx8O88983 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx8O88983 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms