Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc6O88978 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc6O88978 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms