Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkcO88445 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkcO88445 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AurkcO88445 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AurkcO88445 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AurkcO88445 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AurkcO88445 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AurkcO88445 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AurkcO88445 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AurkcO88445 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AurkcO88445 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms