Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn4O70507 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn4O70507 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn4O70507 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms