Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf5O70191 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf5O70191 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf5O70191 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf5O70191 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf5O70191 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf5O70191 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf5O70191 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atf5O70191 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf5O70191 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf5O70191 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf5O70191 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms